কিভাবে প্রান্তিককরণ স্কোর গণনা করা হয়?
কিভাবে প্রান্তিককরণ স্কোর গণনা করা হয়?

ভিডিও: কিভাবে প্রান্তিককরণ স্কোর গণনা করা হয়?

ভিডিও: কিভাবে প্রান্তিককরণ স্কোর গণনা করা হয়?
ভিডিও: বৃষ্টি নামলেই পাল্টে যায় স্কোর! কিন্তু কীভাবে হয় DLS এর হিসাব নিকাশ? | DLS 2024, নভেম্বর
Anonim

দ্য স্কোর একটি প্রান্তিককরণ , এস, গণনা করা প্রতিস্থাপন এবং ফাঁকের যোগফল হিসাবে স্কোর . প্রতিস্থাপন স্কোর একটি লুক-আপ টেবিল দ্বারা দেওয়া হয় (দেখুন PAM, BLOSUM)। ফাঁক স্কোর সাধারণত হয় গণনা করা G এর সমষ্টি হিসাবে, ফাঁক খোলার জরিমানা এবং L, গ্যাপ এক্সটেনশন পেনাল্টি। n দৈর্ঘ্যের ব্যবধানের জন্য, গ্যাপ খরচ হবে G+Ln।

তদনুসারে, প্রান্তিককরণ স্কোর কি?

সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ এবং প্রান্তিককরণ স্কোর একটি সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ একটি প্রান্তিককরণ সর্বোচ্চ প্রদান স্কোর , এবং প্রান্তিককরণ স্কোর এই সর্বোচ্চ স্কোর . অর্থাৎ, দ প্রান্তিককরণ স্কোর X এবং Y = the স্কোর একটি সর্বোত্তম অধীনে X এবং Y এর প্রান্তিককরণ . উদাহরণস্বরূপ, দ প্রান্তিককরণ স্কোর নিচের X এবং Y এর মধ্যে 36 হল।

উপরের পাশে, কিভাবে ক্রম প্রান্তিককরণ কাজ করে? জৈব তথ্যবিজ্ঞানে, ক ক্রম প্রান্তিককরণ সাজানোর একটি উপায় ক্রম ডিএনএ, আরএনএ, বা প্রোটিনের মধ্যে সাদৃশ্যপূর্ণ অঞ্চলগুলি সনাক্ত করতে যা কার্যকরী, কাঠামোগত বা বিবর্তনীয় সম্পর্কের ফলাফল হতে পারে ক্রম.

এখানে, বায়োইনফরমেটিক্সে স্কোর কি?

ক্রম প্রান্তিককরণের প্রসঙ্গে, ক স্কোর একটি সাংখ্যিক মান যা একটি প্রান্তিককরণের সামগ্রিক গুণমানকে বর্ণনা করে। উচ্চতর সংখ্যাগুলি উচ্চতর মিলের সাথে মিলে যায়। দ্য স্কোর স্কেল উপর নির্ভর করে স্কোরিং ব্যবহৃত সিস্টেম (প্রতিস্থাপন ম্যাট্রিক্স, গ্যাপ পেনাল্টি)।

ক্রম প্রান্তিককরণে সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ কী?

দ্য সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ দুটি প্রোটিনের ক্রম হয় প্রান্তিককরণ যে পেয়ার-স্কোরের যোগফলকে সর্বাধিক করে তোলে প্রবর্তিত ব্যবধানের জন্য কোনো শাস্তি কম। ডায়নামিক প্রোগ্রামিং এর অনুমতি দেয় সর্বোত্তম প্রান্তিককরণ দুই ক্রম mnsteps এর ক্রমানুসারে পাওয়া যাবে, যেখানে m এবং n এর দৈর্ঘ্য ক্রম.

প্রস্তাবিত: